温度偏高、多雨的年份发病重；田块间与易发芹菜软腐病的作物连作（土壤中病原细菌积累多）、地势低洼、排水不良的发病较重。
芹菜软腐病是由细菌胡萝卜软腐欧氏杆菌感染所导致，主要随病株残存构造遗留在田间或堆肥中越冬。在环境条件合适时，病菌借雨水、浇灌水及传病虫豸如黄条跳甲、菜青虫等传播，从植株根部的天然裂口、机械造成的伤口、害虫所致伤口侵入，并进入导管潜伏滋生，引起首次、再次感染。
温度偏高，多雨的年份发病重。
年度间春、夏、秋季温度偏高、多雨的年份发病重；田块间与易发芹菜软腐病的作物连作（土壤中病原细菌积累多）、地势低洼、排水不良的发病较重；栽培上有机基肥不足、夏秋季播种过早、种植过密、通风透光差、氮肥施用过多则发病重。
主要随病株残存构造遗留在田间或堆肥中越冬。在环境条件合适时，病菌借雨水、浇灌水及传病虫豸如黄条跳甲、菜青虫等传播，从植株根部的天然裂口、机械造成的伤口、害虫所致伤口侵入，并进入导管潜伏滋生，引起首次、再次感染。
芹菜软腐病病菌可在土壤中，病残体等进行越冬，第2年适宜的时期进行感染，软腐病病菌传播途径多，可顺灌溉水，雨水，粪肥等进行传播，病原菌一般通过农事操作，地下害虫，低温冻害等造成的伤口入侵。