一是要做好种子消毒，二是做好土壤消毒处理。
番茄炭疽病主要为害成熟果实。多在果实着色后，病部初生水渍状透明小斑点，很快扩大成直径5～10毫米圆形或近圆形病斑。病斑呈黑色，略凹陷，具同心轮纹，其上密生黑色小点，即病菌分生孢子盘，这是该病的诊断特征。潮湿时病斑可分泌淡红色黏质物，初期果实不腐烂，后期引致果腐、脱落。
炭疽病可以使用咪鲜胺、苯醚甲环唑、溴菌腈、甲基硫菌灵、二氰恩醌等药剂喷雾防治。
选用抗病品种，清洁田园，去除病株，切断病原，喷施百菌清、代森锰锌等杀菌剂。
用苯醚甲环唑，或噻菌铜，或噻森铜，或咪鲜胺，或吡唑醚菌酯，或代森锌，或丙森锌进行防治，每7~10天叶面喷洒一次，连续喷洒2~3次，即可控制发病，并使患病植株恢复正常生长。加入磷酸二氢钾和天然芸苔素同喷，防治效果更佳。
1、使用无病种子，或用52℃温水浸种30分钟进行种子消毒处理。2、使用无病土育苗，定植田与非茄科作物进行二年以上轮作。3、注意避免高温高湿条件的出现，要适当控制灌水和雨后及时排水。4、做好田园清洁工作，及时摘除病果和清理病残体。
炭疽病用苯醚甲环唑1000-1500倍液，先正达阿米妙收，吡唑醚菌酯，750-1500倍液，杜邦的阿砣，啶氧菌酯1500-2000倍液拜耳好力克，戊唑醇3000-4000倍液先正达好迪施，百菌清100-150克/亩。
种植西红柿前做好土壤的消毒工作。
.加强栽培控病管理（1）收获后做好清园工作，销毁病残体；（2）深翻晒土，结合整地施足量优质有机底肥，高畦深沟栽植；（3）番茄是生长期较长的作物，要精心管理，及时整枝、打杈、绑蔓，勤除草以利田间通风降湿，果实成熟期及时采收，提高采收质量，病果带出田外及时销毁。