苹果病害发生的原因可以划分成两大类，一类是由不适宜的环境条件所造成，称为非侵染病害。如苹果开花期遭受的冻害、由缺锌引起的小叶病、由缺铁引起的黄叶病，以及在贮藏期发生的虎皮病等，因农药和化肥使用不当或环境污染造成的伤害也属于此列。另外一类病害是侵染性病害，这类病害由病原微生物引起，具有传染性。
主要有腐烂病，干腐病，白粉病，轮纹病，等等。
修剪，蚜虫，瘿螨等都可能导致苹果病毒病的发生。
1.土肥管理不当：果农不重视苹果地下管理，最终导致果园土壤酸化、板结、养分吸收利用差，各种营养元素不平衡，树体衰弱，病毒病发生严重。2.负载量过重：挂果过多，树体负载量过重，采果后秋季不施有机肥，严重削弱树势，抗冻抗寒能力差，病毒病发生严重。3、传播途径嫁接传播：病接穗及砧木嫁接传播；