种藕要无伤损，芽完好，子藕做种必须要两节以上，看莲藕的下部是否有长出新嫩芽，并且嫩芽的旁边也会重新长出一些新的根，这样的幼苗是可以直接拿去栽种的。藕种越大越好，这样到时新发育的幼藕也会更好。
种藕选择。莲藕栽培多选用由上年无性繁殖长成的整藕、主藕、子藕等进行栽植。种藕要有完整的顶芽和须根，色泽鲜艳、表皮光滑、藕身建壮、无病无伤，具有明显的品种特征等。以整藕做种时，每株种藕应具有3节完整的藕身，并带1~2株子藕，子藕应向同一方向生长，这样可使抽生出来的藕鞭有规律地生长；以主藕（母藕）做种时，藕身应具有2~3节，且顶芽健壮、无损伤，后把节较粗等；以子藕做种时，要求有2节以上充分成熟的粗壮藕身，且芽旺无损等。也可栽培由顶芽等经假植培育而长成的莲藕幼苗，或从一些科研单位购买人工培养的试管藕或微型种藕进行栽植等。