无公害食品是指按照相应生产技术标准生产的，符合通用卫生标准并经省一级农业行政主管部门认证的安全食品。无公害农产品是无污染，即激素、农药、重金属、亚硝酸盐含量均不超过限制标准要求的农产品及其加工品的总称。
无公害农产品生产对肥料认识存在几个误区:
1.施用有机肥料就是有机农业无公害农业
有机肥料主要来源于植物残体和动物排泄物，一般情况下也是无害的，但是部分畜禽的粪便由于混配饲料中的添加剂，使其中或多或少含有一些重金属、激素或抗生素，如果这种有机肥不加处理或处理不当而施于农田，则对作物造成的污染比施用化肥大得多。当然，氮磷化肥施用不当也会引起水体和大气的污染，如湖泊的富营养化，以及温室气体的排放等对臭氧层的破坏和气候变暖。对此需要通过优化施肥技术，合理施用有机无机肥料，协调高产与环境保护的关系来加以解决。因此，要走出误区，施用没有受到污染的有机肥，确保农产品无公害。
2.无公害农业不能施用化肥
无公害农业并不意味着不施用化肥，无机肥与有机肥相比是绝对安全的，氮肥是空气中的氮、氢和碳元素组成，磷肥中只有含量极低的重金属镉，钾肥中没有有害元素。有机肥只能转变成无机养分形态后才能被作物吸收利用。如有机氮在土壤中90%需要转化为铵态氮和硝态氮后才能被作物吸收利用。据著名的氮肥权威、中国农科院林葆研究员提出：化肥本身不存在重金属等有害物质超标的问题，而值得注意的是防止农业环境（土壤、水、空气）的污染；在绿色农业生产中，不应排斥施用化肥（特别是含硝态氮的肥料），而是应该走有机无机肥相结合的路子。化肥与农药是性质完全不同的两类农用化学品，在讨论其对农产品和环境的污染时，不应混为一谈；从植物矿质营养理论出发，不论施用有机肥料或化学肥料，作物主要以矿物质形态（无机形态）吸收养分，不应把有机肥与化肥对立起来，认为施用有机肥的农产品是绿色和有益健康的，施用化肥是有害健康的。因此，要及时走出误区，合理施用化肥，增加农作物产量，改善其品质。
再者，在化学氮肥中，不应把硝态氮和铵态氮对立起来，从而禁止使用硝态氮肥。因为土壤中尤其是旱地本身就存在硝态氮，施用铵态氮肥后只要条件适宜，很快就会转化成硝态氮。而且有些作物如蔬菜、烟草是喜硝态氮作物。国内外的一些试验都证明，硝态氮和铵态氮的配合使用，往往有较好的增产效果，也使其品质改善，而且亚硝酸盐含量不超标。
目前，无公害生产允许使用的肥料种类有：
１.有机肥：堆肥、沤肥、厩肥、沼气肥、绿肥、作物秸秆、饼肥。
２.无机肥：矿物氮肥、矿物钾肥和矿物磷肥（磷矿粉）、石灰石；按土肥、农技部门指导的优化配方施肥技术方案配制的氮肥（包括碳铵、硫铵）、磷肥（包括磷酸二铵、磷酸一铵、过磷酸钙、钙镁磷肥）、钾肥和其它符合要求的无机复合肥。微量元素肥料：以铜、锌、铁、锰、硼、钼等微量元素及有益元素为主配制的肥料。中量元素肥料：以钙、镁、硫、硅等中量元素为主配制的肥料。
３.微生物肥料：植物生长辅助肥料，用天然有机提取液或接种有益菌类的发酵液，添加一些腐殖酸、藻酸、氨基酸、维生素、糖等配制的肥料（包括活性四维肥、土壤活性剂及根瘤菌、固氮菌、磷细菌、硅酸盐细菌等复合微生物肥料）。
４.复合肥料：以上述肥料中的两种或两种以上养分，按科学配方配制而成的有机和无机复合肥料。