植物矮，干燥，白穗黑脚，也称为“三黑”，即黑根、黑脚、黑膏药。
芽鞘受侵染变褐，继而烂芽枯死，不能出苗。主要发生在小麦的叶鞘和茎秆上。小麦纹枯病菌可以侵染刚发芽的种子，幼苗出土前幼芽鞘变褐，继而腐烂成烂芽不能出土。
小麦全蚀病由小麦顶囊壳菌引起，是一种典型的根部病害。潮湿情况下，在茎基部表面及叶鞘内布满紧密交织的黑褐色菌丝层，形成基腐性的黑脚。剥开病株基部叶鞘，可见到该病独特的黑膏药状物质，上密布黑褐色颗粒状子囊壳。
主要为害小麦地下部分根部和茎基部1-2节处。小麦抽穗后田间病株成簇或点片状发生早枯白穗，病根变黑，易于拔起。在茎基部表面及叶鞘内布满紧密交织的黑褐色菌丝层，呈“黑脚”状，天线后颜色加深呈黑膏药状，上密布黑褐色颗粒状子囊壳。