发病植株一般比正常植株稍矮且细。多数病株雌穗发病较多，果穗较短，基部粗顶端细，近似纺锤形，不吐花丝，除苞叶外整个果穗变成一个大黑粉包。初期苞叶一般不破裂，黑粉也不外露，后期苞叶破裂，散出黑粉。
该病表现在成株期一般是在玉米抽雄吐丝后表现出典型症状：发病植株一般比正常植株稍矮且细。多数病株雌穗发病较多，果穗较短，基部粗顶端细，近似纺锤形，不吐花丝，除苞叶外整个果穗变成一个大黑粉包。初期苞叶一般不破裂，黑粉也不外露，后期苞叶破裂，散出黑粉。
玉米丝黑穗病属苗期侵入的系统侵染性病害。一般在穗期表现典型症状，主要危害雌穗和雄穗。受害严重的植株，在苗期可表现各种症状。幼苗分蘖增多呈丛生形，植株明显矮化，节间缩短，叶片颜色暗绿挺直，农民称此病状是：个头矮、叶子密、下边粗、上边细、叶子暗、颜色绿、身子还是带弯的。有的品种叶片上出现与叶脉平行的黄白色条斑，有的幼苗心叶紧紧卷在一起弯曲呈鞭状。
症状，雄穗发病后，部分或整个花器变形，基部膨大，内包黑粉，雌穗发病后形成灰包，病株的果穗较短，基部大而顶端尖，果穗变成一团黑粉。
主要危害玉米的果穗和雌花，一旦发病，通常全株颗粒无收。因此，该病的发病率即等于病害的损失率。一般在出穗后显症，但有些自交系在苗期显症，在4～5叶上生1～4条黄白条纹；另一种植株茎秆下粗上细，叶色暗绿，叶片变硬、上挺如笋状；还有一些二者兼有或6～7片叶显症。雄穗染病有的整个花序被破坏变黑；有的花器变形增生，颖片增多、延长；有的部分花序被害，雄花变成黑粉。雌穗染病较健穗短，下部膨大顶部较尖，整个果穗变成一团黑褐色粉末和很多散乱的黑色丝状物；有的增生，变成绿色枝状物；有的苞叶变狭小，簇生畸形，黑粉极少。偶而侵染叶片，形成长梭状斑，裂开散出黑粉或沿裂口长出丝状物。病株多矮化，分蘖增多。
玉米丝黑穗病的典型病症是雄性花器变形，雄花基部膨大，内为一包黑粉，不能形成雄穗。雌穗受害果穗变短，基部粗大，除苞叶外，整个果穗为一包黑粉和散乱的丝状物，严重影响玉米产量。
玉米丝黑穗病属于典型土壤传播系统侵染性病害。在苗期至成株期均可表现症状。一旦发病往往全株颗粒无收。苗期发病幼苗分蘖增多呈丛生型，植株明显矮化，节间缩短，叶色暗绿；有的叶片上出现与叶脉平行的黄白色条斑；有的幼苗心叶紧紧卷在一起弯曲成鞭状。成株期病株果穗较短，整个果穗变成一个黑粉包。苞叶破裂散出黑粉。