叶片受害，初为暗绿色水浸状病斑，病部缢缩，叶片变黄凋萎。天气潮湿时病斑软腐，有灰白色霜。叶鞘受害呈褐色水浸状病斑、软腐、叶剥离。鳞茎、根部受害呈软腐，影响养分的吸收和积累。
疫病在韭菜各个部位均能被侵染，以假茎和鳞茎受害最重。
韭菜疫病主要的危害对象是其叶片，在染病初期的时候，叶片会逐渐出现许多水渍状的斑点。斑点会随着时间的推移而逐渐扩大相互融合，导致叶片黄化枯萎死亡。在湿度大的时候，斑块还会出现软腐现象，出现白色的菌丝。叶鞘受害与叶片症状类似，导致叶片与植株分离，并且还会影响根部的生长。导致营养、水分吸收受阻，降低韭菜的养分吸收，严重的时候造成韭菜死亡。