农业防治：收获后将病株带出田外并集中焚毁，藕田保持一定水位。生长期间，加强水肥管理，合理密植，提高莲藕的抗病能力。
化学防治：发病初期及时摘除病叶，并每隔10-15天使用65%代森锌600倍液或70%甲基托布津1000倍液防治一次，一共喷洒2-3次。
一、莲藕黑斑病的防治方法
1、收获后病株集中烧毁，消灭越冬菌源。藕田保持一定水位，防止风害造成叶片损伤。
2、 加强肥水管理，合理密植，改善通风透光条件，提高莲藕抗病能力。
3、发病初期摘除病叶，并喷药防治。常用70%甲基托布津1000倍液，或65%代森锌600倍液，或1:1:160-200倍波尔多液，每隔10-15天喷1次，共喷2-3次。除此之外，也可以使用嘧菌酯、苯醚甲环唑、丙森锌+异菌脲、腐霉利+代森联、丙森.多菌灵等药剂进行防治。
二、莲藕黑斑病的症状
莲藕黑斑病仅发生在叶片上，严重时病斑汇合，叶片枯黄。
三、莲藕发黑是什么原因
1、第一种原因是莲藕接触到了空气，发生氧化所以变黑了，这种情况下变黑的莲藕还是可以继续食用的。
2、第二种原因是莲藕出现了霉变的情况，这种情况下的莲藕就不要再继续食用了，具体是否可以食用可以通过肉眼辨别的，食用的时候注意一下即可。
四、莲藕用什么农药
莲藕不同病害所用农药不相同。莲藕褐斑病可以用25%多菌灵600倍液或75%百菌清1000倍液喷雾，莲藕黑斑病70%甲基托布津1000倍液、65%代森锌600倍液或1:1:160～200波尔多液喷雾防治。使用农药过程中要注意比例，不可过量。